La chapelle des comtes a été aménagée à la fin du XVe siècle dans l’une des tours d’enceinte du château fort, dont la vocation défensive a perdu de son importance. D’après la date sculptée sur la porte, ce remaniement remonte à 1480 à l’initiative de Louis Ier de Gruyère et de son épouse Claude de Seyssel. Le couple, qui est à l’origine de la transformation de la forteresse en une demeure seigneuriale, est représenté sur la partie basse du vitrail de droite, où figurent également leurs armoiries. Les parties hautes des vitraux évoquent deux scènes bibliques : le baptême du Christ par Jean le Baptiste dans les eaux du Jourdain et la Vierge Marie pleurant son fils mort sur ses genoux.
Le décor de la chapelle est aujourd’hui difficilement lisible en raison de l’importante dégradation des peintures. Au centre de la voûte est représenté un Christ en gloire fortement restauré, assis sur un trône au centre d’une mandorle, entouré des symboles des quatre évangélistes dont seul l’aigle se dessine encore. De part et d’autre de la représentation se déroule un décor architectural peint décrivant un plafond à caissons ornementé de fleurs de type Renaissance. Sur les murs, des silhouettes de figures en pied semblent indiquer que le décor décrivait probablement le collège des apôtres.
